En la actualidad, la mejor aplicación móvil para JIRA puede ser Mobile Safari. ¿Ha intentado instalar el interfaz de iPhone JIRA de Atlassian?
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Parece que has probado la mayoría de las aplicaciones disponibles. El único que no he probado es Undock: cuesta $ 5, pero es compatible con Gemini, Basecamp y Bugzilla, así como con JIRA. Tiene excelentes críticas, así que podría valer la pena intentarlo.
En su defecto, tienen el código fuente del complemento JIRA en Bitbucket. Actualizarlo a JIRA 5 sería bastante difícil, pero aposté que actualizar de 4.2.4 a 4.3 no sería tan malo.