El seguimiento de esto de vuelta a la raíz me hace pensar que deshabilitar la descarga / importación automática de iPhoto solucionará el problema.
Aún puede mantener activado Photostream, pero tendría el control para resaltar las fotos que desea importar y hacer clic en "Importar foto". O bien, resalte todas las fotos que nunca desee en Photostream, elimínelas de Photostream y, a continuación, resalte todo y seleccione 'Importar'.
Sí, es un poco más manual, pero no hay muchos tonos de gris con iCloud.
No iré tan lejos como para sugerir que se desactive Photostream, ya que es una copia de seguridad adecuada de último recurso, y cuando eliminas fotos del rollo de la cámara de tu iPhone, esas fotos no volverán a tu iPhone, por lo que no hay preocupación allí.