Fuentes confiables como Macworld indican que el Finder dibuja iconos de escritorio no genéricos de la misma forma en que dibuja ventanas abiertas, y cuanto más hay, más tiempo de memoria y procesador se necesita para actualizar el escritorio. No he encontrado ninguna fuente que indique que este es un factor importante en la velocidad del sistema, pero sí, más iconos personalizados en el Escritorio requieren más recursos cuando la computadora vuelve a dibujar el Escritorio.
¿Qué quieres decir con "iconos en el escritorio"? Sin embargo, tener archivos (documentos, imágenes, etc.) no ralentiza la máquina. Ahora, si se está refiriendo a las aplicaciones en su Doc, tiene mucho abierto y dependiendo de qué aplicaciones tenga. Los widgets pueden ralentizar un poco el sistema. Es posible que desee consultar también la actualización de su memoria si su sistema simplemente viene con el mínimo. Tengo un MBP y después de actualizar la memoria de 4 a 8 GB, observé una gran mejora positiva.