Dos posibles causas para sus problemas, como lo veo con la información proporcionada, es que el comando de bendición para el SSD está dañado o su NVRAM está dañada.
¿Ha intentado reiniciar la NVRAM / PRAM? Esto se hace manteniendo presionado opt + cmd + p + r justo después de encender la Mac. Mantenga presionadas estas cuatro teclas hasta que escuche el timbre de arranque por tercera vez, luego de lo cual podrá soltar y su sistema habrá borrado lo que arranca de forma predeterminada.
Esa es solo la primera parte de la solución porque se iniciará más rápido ahora (o debería), pero necesita decirle a su sistema que inicie el SSD. Vaya a Preferencias del sistema y luego a Disco de inicio como Kent sugiere y resalte el SSD. En este punto, incluso voy lo suficientemente lejos como para decirle a Startup Disk que se reinicie ... Esto lo probará de inmediato y ahora puede dejarnos si eso resolvió los problemas que tiene.
De lo contrario, es posible que tenga un sistema operativo dañado o alguna configuración dañada que haga que sus reinicios no sean limpios. Me encanta un programa llamado Onyx para borrar cachés y estados de aplicación guardados. Pruébelo si el problema persiste y devuélvalo si es necesario. enlace