En pocas palabras; No, no hay una manera fácil de actualizarlos. (Suponiendo que la compilación desde la fuente no se considera fácil)
Le recomiendo que no modifique las versiones instaladas del sistema, ya que es probable que sus versiones actualizadas se rompan cuando Apple publique una actualización que las actualice. (Por lo general, las actualizaciones de seguridad y ha mordido a algunos usuarios / administradores de sistemas cuando se ha actualizado Perl)
Si desea actualizarlos, es cuestión de descargar los archivos de origen e instalarlos sobre las versiones provistas.
Como una alternativa razonable, recomiendo instalar su propia versión administrada de PHP y MySQL en /usr/local
o usar el software de empaquetado de su elección (MacPorts, Fink o Homebrew) o el instalador preparado (por ejemplo, el instalador .pkg de MySQL que se instala en /usr/local
).