También estoy ejecutando Textmate 2.0 alpha.9547, ¡así que estoy bastante interesado en escuchar cuál de las actualizaciones del paquete causó el problema!
Pero para su problema, una forma simple sería restaurar el paquete ofensivo desde sus copias de seguridad.
En mi sistema, encuentro los paquetes en:
/Users/[username]/Library/Application Support/TextMate/Managed/Bundles
El método más difícil sería localizar el sitio de descarga del paquete y obtener una copia anterior. El repositorio del paquete textmate está en: enlace
Para encontrar un paquete en particular, simplemente agregue el nombre del paquete, incluida la extensión del archivo a esta ruta. Por ejemplo, la fuente del paquete TODO está en enlace
A partir de ahí, deberá clonar el repositorio de git y luego usar los comandos de git para verificar la versión anterior de la fuente.
Veo que parece haber un cambio global para agregar un "ruby1.8 shim" hace 6 días y los paquetes se han modificado como notaste. Hice algunas comprobaciones rápidas y parece que estoy ejecutando con las mismas modificaciones y, por lo que sé, los paquetes están funcionando bien.
(habría hecho esto como un comentario a la pregunta pero todavía no tengo suficiente reputación.)