Lo primero que debe intentar es instalar la Update 10.7.3 (Combo del cliente) de OS X Lion . Si eso no reemplaza esos archivos, entonces tendría que reinstalar OS X sobre su instalación existente.
Sin embargo, dado que ya estás perdiendo el tiempo dentro de la carpeta del sistema, es posible que te interese intentar copiar esos archivos desde tu partición de recuperación de HD. Para hacer esto, necesita montar el HD de recuperación, luego montar la imagen del sistema base en él.
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Monte el HD de recuperación en el terminal con este comando:
diskutil mount "Recovery HD"
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Monte BaseSystem.dmg con este comando:
hdiutil mount /Volumes/Recovery\ HD/com.apple.recovery.boot/BaseSystem.dmg
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Luego puede intentar copiar los archivos de la imagen de disco del "Sistema base de Mac OS X" en la carpeta del sistema. Después de copiar, asegúrese de que el propietario / los permisos sean correctos (sería una buena idea ejecutar los permisos de reparación de la Utilidad de Discos).
No he probado esto, pero el tamaño de los archivos de cada uno es el mismo tanto en la imagen del sistema base como en la instalación completa de OS X, por lo que parece probable que sean iguales.