Puedes eliminar manualmente la partición Bootcamp usando la Utilidad de Discos. Esta respuesta supone que solo tienes dos particiones, una macOS y una Bootcamp.
Paso 1: Abre la Utilidad de Disco. Lo puedes encontrar con una búsqueda de foco.
Paso 2: Si está usando macOS High Sierra, elija una de las particiones internas (como Macintosh HD) de la lista de la izquierda. Si está utilizando macOS Sierra o una versión anterior, elija su disco interno (como APPLE SSD).
Paso 3: haz clic en el botón "Partición" que se encuentra en la parte superior de la ventana.
Paso 3.1: Si la Utilidad de Discos le informa algo sobre APFS, seleccione la primera opción, que es "Partición".
Paso 4: Debería haber aparecido un pastel de tu disco ahora. Desde allí, selecciona Bootcamp, luego presiona "-", ubicado debajo del pastel.
Paso 5: Presiona aplicar y espera a que termine. Si falla, vuelva a intentarlo.
Una vez hecho esto, puedes usar Bootcamp Assistant para volver a instalar Windows.