En OS X El Capitán, el archivo de Safari Reader View para modificar el CSS ya no se encuentra en la aplicación Safari y en /System/Library/PrivateFrameworks/Safari.framework/Versions/A/Resources/
.
¿Dónde está ubicado?
¿Está también bloqueado por la integración del sistema?
Si no hay forma de modificar, creo que en la degradación a OS X Yosemite.