Apple dice que para eliminar un elemento del muelle en Yosemite, arrástralo desde el muelle hasta que veas una bocanada de humo. Lo arrastré desde el muelle, tiene una etiqueta llamada "eliminar" pero nunca se convierte en humo. Simplemente regresa al muelle.
A pesar de que los artículos parecían no estar abiertos, estaban abiertos. Al mantener presionado el botón derecho del mouse sobre el ícono, apareció un menú desplegable con la opción de "salir". Seleccione ese elemento y se eliminará el icono.
Esto puede ser causado por un par de cosas.
Comience con la reparación de los permisos del disco a través de la Utilidad de disco. Abra la Utilidad de Discos, seleccione la unidad de la lista de la izquierda y haga clic en Reparar permisos de disco. Cuando haya terminado, reinicie su computadora. Según Apple, la reparación de los permisos solo se aplica a los "archivos instalados por el instalador de Mac OS X, la Actualización de software o un instalador de software de Apple. No repara los permisos de sus documentos, su carpeta de inicio o las aplicaciones de terceros".
El reinicio puede solucionar el problema, pero temporalmente. Si es así, podría deberse a una aplicación de terceros que interfiere con la función normal de los Docks. Deshabilite los elementos de inicio de su cuenta y vea si el problema persiste. También puedes probar y crear una cuenta de usuario nueva y limpia y ver si el problema afecta a todo el sistema o solo es específico de tu cuenta.
Pensé que esto podría ser tarde pero puede ayudarte a resolverlo. Abra Terminal en Utilidades y use esta línea de comando:
los valores predeterminados eliminan com.apple.dock; muelle killall