Bien, encontré una solución utilizando Hazel :
Creé una regla basada en su publicación Cómo hacer que Hazel se vaya en subcarpetas :
Si (...) El tipo es la carpeta
Haz lo siguiente (...) ejecuta reglas en el contenido de la carpeta
La siguiente regla selecciona un determinado conjunto de archivos, por ejemplo,
Si (...) Tipo es pdf
Haga (...) Ejecutar script incrustado de AppleScript
El script es
tell application "Finder"
set extension hidden of theFile to true
end tell
Definí más condiciones y más tipos de archivos diferentes, por lo que no funciona en todos como se solicita. Con un número limitado de archivos diferentes, esto no debería ser un problema.