No debería tener ningún impacto en el rendimiento ni en la duración de la batería.
Creo que se utiliza la misma cantidad de chips de memoria flash en los modelos de 32 GB y 64 GB, solo en diferentes capacidades, por lo que el consumo de energía sería casi idéntico. De cualquier manera, la memoria flash consume muy poca energía en comparación con cosas como la pantalla y las radios inalámbricas, por lo que cualquier impacto sería casi imperceptible.
En cuanto al rendimiento, no he visto ninguna métrica, pero el rendimiento de iOS no se ve realmente afectado por la capacidad del dispositivo. La posible excepción aquí es cuando tienes muy poco espacio libre, pero eso es solo una suposición.
En conclusión, sugeriría que no se preocupe por eso, simplemente compre la capacidad según su presupuesto y sus necesidades.