Las fotos en el dispositivo iOS nunca se guardan solo en la copia de seguridad. Lo que se almacenaría en la copia de seguridad son las imágenes eliminadas que ya no tiene en el rollo / álbumes de la cámara.
En lugar de eliminar la copia de seguridad completa para hacer espacio en iCloud, puede optar por no hacer una copia de seguridad del rollo de la cámara hasta que se pueda hacer una copia de seguridad de todas las fotos del rollo de la cámara en otra parte.
Consulte mi respuesta en ¿Cómo puedo eliminar imágenes de Photo Stream para liberar espacio de almacenamiento de iCloud? para más detalles.
Las cosas se complican más en iOS 8/9 con el advenimiento de la biblioteca de fotos almacenada en iCloud. Desearía cargar una imagen desde su teléfono que muestre el uso de iCloud:
Configuración > iCloud > Almacenamiento > Gestionar almacenamiento
Si tienes una biblioteca de fotos de iCloud en la parte superior como lo hago anteriormente, ve a Configuración > iCloud > Fotos para verificar si sus fotos en ese teléfono son parte de la nube. Los pasos para hacer espacio son más complicados que simplemente eliminar una copia de seguridad o configurar el rollo de la cámara para que no se conviertan en iCloud.