¿El calendario del iPod Touch es compatible con la programación cada dos días?

Puedes configurarlo, pero no en el dispositivo. No hay interfaz para reglas de recursión más complejas en la aplicación de calendario de iOS.

Si estás sincronizando con iCal en un mac, agregas el evento a iCal y accedes a la configuración de repetición "personalizada", y es fácil repetirlo cada dos días.

Sincroniza tu dispositivo y Bob es tu tío.