Desafortunadamente, Apple ha 'decretado' que ninguno usará un iPhone / iPod sin el uso simultáneo de iTunes para administrar el dispositivo.
Sí, esto es lo que dijeron otras personas, pero con la adición de que realmente no puedes. No sin una buena cantidad de piratería en el iPhone. El sistema de archivos del iPhone no está expuesto al uso general y no está diseñado para ser utilizado con Linux (por ejemplo, no iTunes para Linux). Si bien podría existir una manera (y un lugar) para copiar sus archivos de audio (sí, el iPhone reproduce archivos genéricos de MP3 y WAV) en su iPhone de forma manual, generalmente no es compatible.
Lo que quizás quieras hacer es ver si hay una aplicación equivalente de iTunes para Linux que te permita sincronizar música / podcasts / etc. Si lo hace, publíquelo aquí, podría ser útil para otros.