Si está utilizando algo como la unidad Optibay de MCE Tech, puede poner cualquiera de las unidades en el caddie . Prefiero hacer un solo cambio a la vez, así que cuando hice esto, puse la nueva unidad en el caddy y dejé sola la antigua unidad de arranque que funcionaba.
En cuanto a la instalación desde una unidad de memoria USB (supongo que esto es lo que querías decir ya que no eras claro), no deberías hacerlo. Puedes descargar el instalador de Mountain Lion y ejecutar la aplicación. Durante el proceso de instalación, puede elegir en qué unidad instalar el sistema operativo, simplemente elija la SSD recién instalada y formateada.
Una vez que tenga ambos sistemas operativos instalados, el sistema recordará la última unidad que se seleccionó en las preferencias de Disco de inicio y almacenará esa elección en la NVRAM para que continúe comenzando desde la unidad preferida. Puede mantener presionada la tecla de opción en el inicio para evitar esta elección y seleccionar todas las unidades de inicio cuando desee cambiar las cosas en un inicio específico.
La mayoría de las personas encuentran que tener dos sistemas operativos internamente es confuso. Spotlight intentará encontrar la versión correcta de Safari si no los mantienes actualizados, pero a veces terminas ejecutando la versión incorrecta de una aplicación. Esto es confuso en el mejor de los casos, y la mayoría de las veces es problemático y puede causar problemas con los datos cuando la versión incorrecta de una aplicación abre datos que no esperaba de una versión más nueva de iPhoto, por ejemplo.