Algunas pautas, Time Machine no eliminará los archivos que no escribió en la carpeta Backups.backupdb y esa carpeta tiene permisos para hacer casi imposible que alguien almacene archivos allí accidentalmente.
Otros archivos fuera de ese directorio son tan seguros como lo serían sin Time Machine usando la unidad. (Lo que significa que, a menos que se realice una copia de seguridad en otro lugar, no es seguro guardar una copia de un archivo)
Time Machine calcula la cantidad de espacio que necesitará antes de que comience a copiar los archivos, y ese cálculo es bastante seguro, ya que sobreestima el espacio que necesitará (a veces bastante) y solo eliminará los archivos que escribió en el Directorio protegido si necesita liberar espacio.
Una vez que haya terminado la eliminación, si le pidió a Time Machine que le notificara después de eliminar los archivos, recibirá una advertencia de que la unidad se agotó y que la copia de seguridad provocó que ocurriera más de lo normal.