Sí. Todos los datos de iCloud están protegidos en reposo como mínimo, como se describe en el documento de seguridad que Apple publica regularmente.
Cada archivo se divide en fragmentos y se cifra mediante iCloud utilizando AES-128 y una clave derivada de los contenidos de cada fragmento que utiliza SHA-256. Apple almacena las claves y los metadatos del archivo en la cuenta de iCloud del usuario. Los fragmentos cifrados del archivo se almacenan, sin ninguna información de identificación del usuario, utilizando servicios de almacenamiento de terceros, como Amazon S3 y Windows Azure.
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Los datos de iCloud Drive y CloudKit tienen capas adicionales de cifrado / claves agregadas, pero para las notas se obtiene el nivel de seguridad descrito donde los datos se cifran antes de que salga del dispositivo y llegue a la red.
La función de contraseña local es únicamente para evitar el acceso a la nota en su (s) dispositivo (s) una vez que la nota se recupera de la nube.