Debes poder hacer esto descargando la extensión del kernel (kext) que controla el trackpad desde la línea de comandos.
sudo kextunload /System/Library/Extensions/AppleUSBTopCase.kext/Contents/PlugIns/AppleUSBTrackpad.kext
para deshabilitarlo. Cambie kextunload
a kextload
para volver a habilitarlo.
Cuando probé esto, se quejó de que no podía descargar el kext, pero pareció deshabilitar el trackpad (y no se mostró en las preferencias del sistema) a pesar de las advertencias.
Advertencia para los usuarios del Magic Trackpad: No tengo un Magic Trackpad, por lo que no sé si este kext es responsable de ese dispositivo o no. Al probar esto con cuidado, puede desactivar accidentalmente todas las entradas del mouse a la vez.
Editar: Hice un poco más de investigación y hay un "AppleBluetoothMultitouch.kext", que parece ser el responsable del Magic Trackpad, por lo que es probable que puedas desactivar el trackpad interno independientemente de Cualquier externo.