¿Puedo mover la carpeta Mobile Sync a otro HD?

Puedes mover la carpeta a otra unidad, luego usar un enlace simbólico para volver a la ubicación original, para que iTunes aún pueda encontrarla.

Un enlace simbólico es un poco como un acceso directo o un alias, que el sistema puede usar para seleccionar un archivo o carpeta en otra ubicación.
Debido al método bastante arcano que necesitaría emplear en Terminal para generarlos, siempre he usado una pequeña aplicación gratuita que se configura como un Servicio en OS X, lo que significa que puede acceder a ella a través del menú del botón derecho - SymbolicLinker

Después de instalar esto [puede ser necesario reiniciar si no se muestra inmediatamente en el menú del botón derecho], el procedimiento sería

• Mueva su carpeta MobileSync a su nueva unidad, Cmd / drag se moverá en lugar de copiar.
• Haga clic con el botón derecho en la carpeta en su nueva ubicación, vaya a Servicios en la parte inferior del menú, luego haga un enlace simbólico
• Cmd / arrastre el enlace creado a la ubicación original en ~ Biblioteca / Soporte de aplicaciones /
• Cambie su nombre para eliminar el 'enlace simbólico' al final, de modo que tenga el nombre original MobilSync
• Hecho.