La indexación y búsqueda de Spotlight (o la configuración de privacidad correspondiente) se basa en el volumen y no en el sistema. Por lo tanto, se aplica la desactivación de Spotlight en un volumen, ya sea que arranque desde uno u otro volumen del sistema.
Entonces, la única posibilidad que veo es la siguiente solución:
No monte el volumen alternativo respectivo mientras se inicia en uno. O móntelo solo para leerlo (Spotlight no lo indexará, pero lo buscará).
Ejemplo (mientras se inicia en Mavericks):
diskutil info /Volumes/NameOfTheYosemiteVolume
Localice el UUID de volumen, seleccione y copie este número.
Abra Terminal y ejecute el siguiente comando para editar el archivo "fstab" (se le pedirá su contraseña):
sudo nano /etc/fstab
Luego agrega
UUID=UUIDFoundAbove none hfs rw,noauto
o
UUID=UUIDFoundAbove none hfs ro,noauto
o
UUID=UUIDFoundAbove none hfs ro
El primero de estos evitará que la unidad se monte, pero si la monta utilizando la Utilidad de Discos u otro medio, entonces la unidad se podrá leer y escribir.
El segundo de estos evitará que la unidad se monte, pero si la monta con la Utilidad de Discos u otro medio, entonces la unidad será de solo lectura.
La tercera opción hará que el disco se trate como de solo lectura, pero seguirá apareciendo automáticamente en el Finder cuando inicies el sistema.
Cuando termine con la edición, presione ctrl o seguido de Entrar o y e Ingrese para guardar los cambios, y luego presione ctrl x para salir del editor.
Para deshacer estos cambios, simplemente ejecute sudo nano /etc/fstab
en la Terminal nuevamente para editar el archivo fstab y elimine las líneas que agregó.
Luego, revertir la configuración de privacidad de Spotlight a la configuración predeterminada.
Esto debería evitar que el volumen de Yosemite se monte después de un reinicio.
Como resultado, Spotlight no debe indexar ni buscar el volumen, si ha elegido una de las dos primeras opciones.
Ahora inicie el volumen de Yosemite y repita todo para el volumen de Mavericks.
El inconveniente de esta solución es que probablemente tenga que presionar el botón alt / opt mientras arranca para seleccionar un volumen de inicio alternativo, porque el PrefPane respectivo muestra solo el actual.