Respuesta corta: no hay forma conocida de acelerar la animación.
Pero es posible que puedas hacerlo un poco más rápido con algunos ajustes.
Tu mejor apuesta es obtener una de las aplicaciones "tweaker" de terceros como Cocktail o TinkerTool y deshabilitar cualquiera de los ojos relacionados con el Dock.
Recomiendo TinkerTool ya que tiene más opciones relacionadas con el Dock ahora mismo.
En particular, recomiendo desactivar "Usar iconos transparentes del Dock para mostrar aplicaciones ocultas". Y active "Deshabilitar el efecto de vidrio tridimensional del Dock".
Esto probablemente solo tendrá un beneficio mínimo, pero podría ayudar un poco.
Y si alguien alguna vez hace descubre cómo acelerar esa animación, serán los equipos de Cocktail o TinkerTool, por lo que tener una de estas aplicaciones significa que probablemente serás uno de los primero en saber.
ETA: La forma más rápida de todas: deshabilitar Auto-Hide.
Mantengo mi Dock en el lado derecho y ocupa muy poco espacio en pantalla. La mayoría de los píxeles verticales son preciosos.
Y con la nueva función FullScreen de Lion, si alguna vez realmente necesito ocultarlo para minimizar las distracciones, simplemente hago FullScreen con la aplicación actual.