Bien, lo descubrí, pero no es sencillo. Pensé que tenía que almacenarse en un archivo .plist en algún lugar, así que busqué en todos los archivos .plist en ~/Library/Preferences
para encontrar los que contenían el ID de Apple que usé para iMessages. Estos fueron los siguientes:
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com.apple.ids.service.com.apple.madrid.plist
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com.apple.ids.service.com.apple.private.alloy.sms.plist
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ByHost/com.apple.identityservices.idstatuscache.5A488A33-7FF1-56F5-A3F6-CBC792D5C705.plist
Cuando busqué com.apple.ids.service.com.apple.madrid.plist
en la web, encontré un enlace a una respuesta muy útil en la Foros de Apple que también ayudaron.
Entonces, básicamente, esto es lo que hice :
Borre los archivos .plist que mencioné anteriormente ( nota, es probable que la última con el UUID en el nombre sea diferente para cada usuario ):
cd ~/Library/Preferences
rm com.apple.ids.service.com.apple.madrid.plist
rm com.apple.ids.service.com.apple.private.alloy.sms.plist
rm ByHost/com.apple.identityservices.idstatuscache.5A488A33-7FF1-56F5-A3F6-CBC792D5C705.plist
Luego eliminé todo el historial de chat y el archivo:
rm ~/Library/Messages/chat.db*
rm -rf ~/Library/Messages/Archive
rm -rf ~/Library/Messages/Attachments
Luego reinicié el Mac por si acaso. Ahora la cuenta y todo lo que ha existido en esta máquina se ha ido :)