Básicamente, una actualización solo hace que muchos de los archivos que se incluyen en una copia de seguridad escriban una copia más reciente. No hay ningún cambio importante en el formato de almacenamiento y no lo ha habido desde que se implementó Time Machine.
Todos los cambios han estado en el código que ejecuta la copia de seguridad o los cambios a las reglas sobre qué archivos están excluidos, pero esos cambios se revierten cuando instala un sistema operativo limpio antes de restaurar archivos desde cualquiera de los intervalos almacenados en el copia de seguridad.
Las copias de seguridad de Time Machine no son de inicio y no incluyen todos los archivos, por lo que es posible que ni siquiera termines restaurando los archivos que cambian cuando pasas de una actualización de SO a otra.
Específicamente, aquí hay archivos que quedan excluidos por regla:
Time Machine simplemente hace una copia de seguridad de todos los archivos que no están en una lista para ser omitidos. Continúa, intervalo de tiempo por intervalo de tiempo: escribe los archivos nuevos y actualiza los archivos modificados. Suponiendo que no se esté quedando sin espacio en el destino de la copia de seguridad, no se eliminarán los archivos antiguos de la copia de seguridad y podría restaurarlos antes de realizar la actualización.