En Safari 5.0 o en una versión inferior, es muy fácil deshabilitar la apertura de archivos PDF en línea, simplemente dices
defaults write com.apple.Safari WebKitOmitPDFSupport -bool YES
y nunca te volverá a molestar.
En Safari 5.1 esto ya no funciona. ¿Alguien sabe una alternativa para evitar que Safari 5.1 abra archivos PDF en el navegador en lugar de descargarlos y luego verlos en Vista previa?