El carácter de tilde es un atajo para el directorio inicial del usuario que ha iniciado sesión actualmente (en sistemas operativos similares a UNIX).
En las rutas de los directorios de iCloud también se incluye.
Por ejemplo:
com~apple~CloudDocs
o
com~apple~mail
¿Qué significa allí?
Y en general: ¿Cuál es la razón de estas extrañas rutas de archivo?
La razón para nombrar cosas como las que comienzan con un dominio de nivel superior y se vuelve más y más específico es agruparlas automáticamente cuando se enumeran. Esta es una práctica común para cosas como clases java o archivos de preferencias (pero generalmente separados por puntos).
El uso del carácter de tilde no tiene nada que ver con el directorio de inicio tilde. Supongo que es solo uno de los últimos símbolos restantes del conjunto de caracteres estándar sin un significado especial en este contexto, mientras que .:;<>$/"*# , etc., puede tener conflictos con diferentes interpretaciones.