Es simple. El calor proviene de los motores de accionamiento que giran, por lo que más calor implica más tiempo de giro. (Y como estos motores giran a velocidades constantes, es más el ciclo de trabajo en el que se encuentran los motores, y entonces la forma en que se controlan los motores afecta la generación de calor).
Supondré que ha seleccionado "Poner el disco duro en suspensión cuando sea posible". en ahorro de energía, ya que es necesario verificar si el Mac OS X indica que las unidades ya no son necesarias. Cuando están inactivos, la generación de calor es menor.
Si solicitó que las unidades queden inactivas seleccionando la opción anterior, entonces debe encontrar qué proceso está sondeando las unidades, lo que las mantiene en un estado de inactividad. El comando fs_usage sería un buen lugar para comenzar a monitorear qué escrituras / lecturas están sucediendo.
Una vez que sepa qué procesos son responsables, tendrá la oportunidad de cambiar las cosas.
Alternativamente, puede usar la Utilidad de Discos para desmontar las unidades. Deberían dormir bien, pero a costa de no estar montados.