En general, no. Cada aplicación es un espacio aislado, un código firmado y actualizado por el proceso de actualización de la tienda de aplicaciones de Mac. Algunas aplicaciones están restringidas por la protección de integridad del sistema.
En concreto, sí, puedes deshabilitar sip si es necesario. Puede deshabilitar el controlador de acceso y modificar la aplicación y volver a habilitarlo. El trabajo de ingeniería para mantener un script general serían días para realizar un marco y luego horas o días antes de la actualización.