De acuerdo con el PyCharm Keymap para Mac, se utilizan las flechas Control + Arriba y las flechas Control + Abajo para navegar entre los métodos anterior y siguiente. OSX, por supuesto, usa estas combinaciones de teclas para (Control + Teclas de flecha) para navegar entre aplicaciones.
¿No hay una solución aparte de volver a asignar estas claves en OSX o en PyCharm?