¿Hay alguna forma de mover archivos a varias carpetas en una sola acción de carpeta?

Puedes usar un script de shell como este:

for f; do
  case $f in
    *.mp3|*.m4a) mv -n "$f" ~/Music;;
    *.jpg) mv -n "$f" ~/Pictures;;
    *) mv -n "$f" ~/Documents;;
  esac
done

mv -n salta un archivo cuando existe un archivo con el mismo nombre en el destino.

Lo que hay que hacer para hacerlo es "Hazel" de noodlesoft: enlace Puede agregar carpetas en Hazel y para cada carpeta puede agregar varias reglas.