Pude resolver esto. Esto es lo que hice:
Paso 1
Genere un archivo con su configuración predeterminada actual:
defaults read com.apple.symbolichotkeys.plist AppleSymbolicHotKeys > file_a
Paso 2
Cambie manualmente la configuración que desee en System Preferences > Keyboard > Shortcuts
Paso 3
Genere un nuevo archivo de comparación a partir de la configuración después de realizar su cambio:
defaults read com.apple.symbolichotkeys.plist AppleSymbolicHotKeys > file_b
Paso 4
Diff compara los dos archivos:
diff file_a file_b
Paso 5
Deshabilite solo las claves que aparecieron en el diff, ejemplo:
defaults write com.apple.symbolichotkeys.plist AppleSymbolicHotKeys -dict-add 82 "
<dict>
<key>enabled</key><false/>
<key>value</key><dict>
<key>type</key><string>standard</string>
<key>parameters</key>
<array>
<integer>65535</integer>
<integer>124</integer>
<integer>8781824</integer>
</array>
</dict>
</dict>
"