Quiero que mi Mac esté ejecutando Sierra, para que deje de ocultarse el Dock cuando ingreso "Comando + Opción + D"

1. Haz clic en el menú de Apple
2. Abre "Preferencias del sistema"

Puede editar el método abreviado de teclado yendo a la aplicación Preferencias del sistema → Teclado → Atajos de teclado → Launchpad & Acople y asigne un método abreviado diferente no conflictivo para alternar la visualización del Acoplamiento.

Vaya a Preferencias del sistema / Teclado, desde allí, seleccione la pestaña Acceso directo en la parte superior de la ventana. La primera opción a la izquierda es LaunchPad y Dock. Cuando selecciona que ve una opción para hacer que control-command-D sea un acceso directo para Dock, desmarque esa opción.

Otra posibilidad es volver a asignar el acceso directo en InDesign a otra cosa.

Puedes hacer esto en Preferencias del sistema > Teclado > Accesos directos > App Accesos directos. Añadir un nuevo acceso directo. Seleccione la aplicación InDesign, el acceso directo que desea usar y el elemento de la barra de menú que este acceso directo activará cuando presione esa combinación de teclas en InDesign (esto solo funcionará si tiene una opción de barra de menú para lo que quiera activar).