Una mejor pregunta es "¿puedo hacer una copia de seguridad de dos unidades diferentes al mismo tiempo?"
Si tiene 4 unidades en total, en 4 conexiones diferentes, entonces sí. Para que quede claro, debe haber 4 dispositivos de almacenamiento físicamente separados involucrados, no solo volúmenes separados. Y "4 conexiones" no incluye dispositivos firewire conectados en cadena o conectados al mismo hub usb (esos cuentan como una conexión).
La ejecución de 2 trabajos de copia en el mismo volumen es un gran éxito de rendimiento: las unidades tienen un solo cabezal de lectura / escritura, por lo que lo mejor que puede hacer es una velocidad de copia secuencial 2x. En realidad, será mucho peor, ya que las cabezas van y vienen constantemente entre los dos trabajos de copia.
La ejecución de datos por el mismo cable eliminará de manera similar cualquier ventaja que obtenga al ejecutar dos procesos.
La única excepción a la regla son las copias en red: la descarga de varios archivos a través de Internet (servidores diferentes) funciona porque su conexión de red externa es mucho más lenta que las conexiones internas que nunca se saturan.