En resumen, estás a salvo.
Dependiendo del software que esté utilizando, lo que solo podría ocurrir es que elimine los álbumes de fotos que tiene sincronizados con su iPhone, que es un manual proceso o estás sincronizando fotos a tu iPhone desde tu mac. Sin embargo, desde que declaró que los importó, no preveo ningún problema.
NOTA si está haciendo referencia a iCloud, entonces tampoco tiene nada de qué preocuparse. iCloud almacena todos los archivos en su iCloud, pero si los elimina de diferentes dispositivos, solo los elimina de ese dispositivo, a menos que no haya tenido tiempo de sincronizarlo con su Mac, pero nuevamente, se importa estrictamente, lo que significa que arrastra y suelta o Al hacer clic en el botón Importar a iPhoto / Aperture, etc., estará listo.