En Yosemite, deshabilité las notificaciones con el siguiente comando de terminal:
cd 'getconf DARWIN_USER_DIR'
rm -rf com.apple.notificationcenter
killall usernoted; killall NotificationCenter
¿Alguien sabe lo que necesito escribir para restaurar la configuración de notificación predeterminada original?
Lo que has hecho aquí es eliminar toda la base de datos del Centro de notificaciones, no simplemente deshabilitar el Centro de notificaciones. Deberá restaurar este contenedor, preferiblemente desde una copia de seguridad. Alternativamente, puedes reinstalar OS X.
Lea otras preguntas en las etiquetas notification-center yosemite