No se puede buscar ningún índice de metadatos cuando los documentos de iCloud se eliminan o no se almacenan localmente. Un archivo solo se indexa cuando se escribe a través del sistema de archivos local y el índice de metadatos se actualiza.
Spotlight solo indexa una unidad local en mi prueba de 10.12.2, por lo que esperaría que perdieras los datos de búsqueda de Spotlight para cualquier archivo que inicialmente se descargue en tu Mac, pero luego se elimine en un espacio reducido en el disco. caché de archivos.
MacOS tiene mecanismos para mantener un índice de reflectores desde un volumen de red remoto y también es posible que Apple pueda diseñar una solución donde los metadatos de los focos se mantengan localmente cuando ocurre la reducción. Simplemente no puedo verificar que la implementación se haya realizado o completado.
Si puedo obtener un caso de prueba, editaré esta respuesta con detalles, pero el trabajo para configurarlo es más complicado que mi curiosidad en este momento. Sería bastante fácil configurar esto si subiera su almacenamiento a 50 GB durante un mes e instale macOS con una unidad de arranque de menos de 50 GB.