Prueba esto:
1) Vaya al Administrador de marcadores de Chrome, menú "Organizar", y exporte sus marcadores como un archivo HTML (guarde este archivo para más adelante).
2) Salir de Chrome completamente
3) Haga clic en su escritorio, luego en el menú del Finder haga clic en "Ir" > "Ir a la carpeta".
4) Ingresa ~/Library/Application Support/Google/Chrome/Default/
en el cuadro, luego haz clic en el botón "Ir" (esto te llevará a donde Chrome almacena la configuración de su perfil de usuario.
5) Cambie el nombre del archivo llamado "Marcadores" a "Marcadores.OLD" y "Marcadores.bak" a "Marcadores.bak.OLD"
6) Inicia Chrome
7) Vaya al Administrador de marcadores de Chrome, menú "Organizar", e importe el archivo bookmarks_x_x_x.html que guardó anteriormente.
8) Sal de Chrome completamente otra vez. Espera unos segundos y vuelve a iniciarlo.
9) Ahora intenta usar el administrador de marcadores de Chrome para crear una nueva carpeta y cambiarle el nombre.
Esperemos que el problema se resuelva.