¿Cómo reemplazar una carpeta cuyo nombre es una fecha, es decir, AAAAMMDD con una jerarquía de carpetas del año, el mes, la fecha?

Suponiendo que todas estas carpetas YYYYMMDD forman parte del mismo directorio principal que podría ejecutar

cd PARENT_DIRECTORY
for d in */; do
    [[ $d =~ [0-9]{8}/ ]] || continue
    mkdir -p -- "${d:0:4}/${d:4:2}"
    mv -- "$d" "${d:0:4}/${d:4:2}/${d:6:2}"
done

• El bucle for d in */; do lee todas las entradas del directorio, el / final garantiza que solo los nombres de los directorios coincidan realmente
• [[ $d =~ [0-9]{8}/ ]] comprueba si la entrada actual consta de 8 dígitos, y continúa con la siguiente entrada, si no
• ${d:0:4}/${d:4:2}/${d:6:2} usa la expansión de parámetros dentro de bash para crear una cadena que contenga la nueva ruta
• El -- en mkdir y mv evita problemas en caso de que el directorio o nombre de archivo comience con un - . Esto no puede suceder aquí, pero probablemente sea una buena práctica de todos modos.

Gracias a @terdon y @ user3439894 por ideas sobre cómo mejorar el script original.

Puedes usar lo siguiente en la Terminal. cd a la carpeta que contiene, luego ejecute lo siguiente:

find . -type f -exec bash -c \
  'F=$(sed -E "s#^\./([0-9]{4})([0-9]{2})([0-9]{2})#//#" <<< $1);\
  mkdir -p -- $(dirname "$F");\
  mv -- "$1" "$F"' - {} \;

find . -type f obtiene recursivamente todos los archivos del directorio actual.
-exec bash -c abre un shell para ejecutar los siguientes comandos.
F=$(…) abre una subshell y usa sed en la ruta del archivo para manipular la ruta en las carpetas.
^\./([0-9]{4})([0-9]{2})([0-9]{2}) es una expresión regular con tres grupos de captura, de la siguiente manera:
//esreemplazo,dondecadagrupodecaptura(,etc.)estáseparadopor/.
mkdir-p--$(dirname"$F") crea los directorios para mover los archivos.
mv -- "$1" "$F" mueve cada archivo a su carpeta correspondiente.

Esto toma la jerarquía de la izquierda y la convierte en la jerarquía de la derecha:

├── 20170201               └── 2017
│   └── abcdefghij             ├── 02
└── 20170302                   │   └── 01
    └── abcdefghij 2           │       └── abcdefghij
                               └── 03
                                   └── 02
                                       └── abcdefghij 2

Si hay otros archivos en la carpeta que contiene una fecha como nombre, se moverán como si fueran una carpeta. Para evitar esto, reemplace la segunda línea con:

  'F=$(sed -E "s#^\./([0-9]{4})([0-9]{2})([0-9]{2})(?:/.+)#//#" <<< $1);\

El (?:/.+) garantiza que la ruta tenga un componente posterior, por lo tanto, ignorando cualquier cosa sin un hijo en el directorio principal, que son archivos.