Si está buscando verificar en un nivel de todo el sistema, entonces las herramientas del Servidor que mencionó anteriormente podrían serle de mayor utilidad. No tengo experiencia con ellos; Recomiendo dos herramientas que son útiles para un usuario individual.
ClamXav (gratis, http://www.clamxav.com/) se basa en el motor ClamAV que mencionó bmike. Se le puede indicar que escanee todo en su disco duro, o solo los archivos a los que se lo diga (por ejemplo, solo los archivos descargados de la web). Específico a sus necesidades, desde su página de inicio: "Enumera claramente los archivos infectados". Supongo, pero no estoy seguro, que tales archivos incluyen archivos PDF e imágenes.
Virusbarrier ($ 49.95, www.intego.com/virusbarrier/ ) y VirusBarrier Plus (99 ¢, Mac App Store son ambos hechos por Intego. La página MAS afirma que este "Encuentra y repara documentos de Microsoft Word, Excel o PowerPoint" y "Encuentra y elimina el malware de PDF", que parece ser lo que estás buscando. Probé VirusBarrier hace un par de años y me pareció bastante decente, pero dejé de usarlo porque era demasiado para mis propósitos.
Uno de esos dos podría arreglarte. Tenga en cuenta que ambos persiguen el malware de Windows y Mac, por lo que no debe preocuparse por enviar malware a una PC con Windows si utiliza uno de los anteriores (en teoría, al menos).
Si está interesado, también le gustaría buscar XProtect . Es un sistema anti-malware integrado en OS X, que busca cosas desagradables. No es tan maduro como los dos productos anteriores (debutó a mediados de 2009, IIRC), pero es una buena herramienta, sin embargo.
En cuanto a algunos de los servicios en línea que mencionó, he encontrado varias páginas de las compañías acerca de su política de escaneo de correo electrónico. Nunca me he encontrado con ninguno de estos analizadores antivirus, por lo que no puedo comentar sobre su calidad.
Google tiene un antivirus en Gmail, como se explica en esta página de asistencia de Gmail :
Gmail escanea automáticamente cada archivo adjunto cuando se le entrega, y nuevamente cada vez que abre un mensaje. Los archivos adjuntos que envíe también se escanean. La verificación de los archivos adjuntos en busca de virus protege a nuestros usuarios y su información, y previene la propagación de virus.
Del mismo modo, Yahoo! escanee y limpie todos sus archivos adjuntos :
Yahoo! Mail escanea automáticamente todos los archivos adjuntos de correo electrónico entrantes y salientes en busca de virus conocidos. Utilizamos el software Norton AntiVirus, líder en la industria, para que no tenga que hacer nada. Descargue el archivo adjunto y espere el mensaje tranquilizador "No se detectó ninguna amenaza de virus". Si se detecta un virus, se limpiará si es posible y se le darán más instrucciones.
No puedo encontrar nada acerca de los escáneres integrados en Windows Live Mail, MobileMe o iCloud. Eso no significa que no existan; simplemente que no aparezcan en una búsqueda de Google.
Espero que algo de esto te sea útil :)