Me he dado cuenta de que faltan algunas de mis carpetas predeterminadas en el buscador (Público, Sitios, Películas, Biblioteca).
Sin embargo, puedo listarlos en el terminal e ingresarlos con el comando cd .
Intenté usar chflags nohidden para hacerlos visibles en el buscador de nuevo, pero no pasó nada.
¿Hay alguna otra forma, para que sean visibles de nuevo en el buscador?
Editar: 
Creo que es un problema de permisos .
diskutil resetUserPermissions / 'id -u'
Después de ingresar el comando diskutil , si la Terminal dice que los permisos se restablecieron en el directorio de inicio del usuario (error -69841), ingrese chflags -R nouchg ~ y vuelva a ingresar el comando diskutil .
También puede verificar si la carpeta Biblioteca de su usuario está configurada correctamente. Abrir el buscador como root:
sudo /System/Library/CoreServices/Finder.app/Contents/MacOS/Finder
Ahora navegue a su carpeta de inicio, haga clic en Carpeta de biblioteca > cmd + J > marque la casilla "Mostrar carpeta de la biblioteca".
Háganos saber si esto resolvió su problema.