Ocasionalmente, al hacer clic en una aplicación abierta en el dock (por ejemplo, Finder.app) se abrirá otra ventana, el mejor ejemplo que puedo dar es que cuando estoy en Photoshop y necesito obtener algo de Finder, hago clic en Finder y Firefox (que ya estaba abierto) muestra la ventana. Esto es muy inconveniente y no puedo encontrar una correlación entre cuándo sucede esto y cuándo no.
EDIT:
Resulta que esto también puede suceder cuando se usa Cmd + Tab
.