Estoy ejecutando Lion (10.7.2), y hay una x justo a la izquierda del botón Instalar / Instalar cuando pasas el cursor sobre el elemento en la lista comprada. Haz clic en él para cada aplicación que no quieras que aparezca en la lista. No creo que esto desinstale la aplicación, simplemente la elimina de la lista. Le hice esto a un programa que realmente quería en la lista, ni siquiera recuerdo que me pidieran confirmación.
Ahora, en cuanto a obtener una aplicación comprada nuevamente en su lista comprada, ese es otro problema, y otra pregunta .