Instalando pymol usando macports en yosemite

En caso de que esto ayude a alguien, esto hará que se compile y se cargue.

Primero Desinstalar Pymol

Entonces:

% sudo port install tcl -corefoundation
% sudo port install tk -quartz
% sudo port install pymol

Esto se describe aquí:

enlace

Mi conjetura es que algo más está en el trabajo.

Las advertencias indican que no tienes instalado Xcode (es decir, herramientas de desarrollo). Muchos paquetes de MacPorts requieren compilación, por lo que necesita el entorno de compilación.

Realmente ayudaría tener la ventana de bloqueo completa, porque hay muchos mensajes útiles para los desarrolladores.

Lo que sigue es una especulación completa de alguien que desarrolla código de código abierto mixto de Python y C / C ++, como PyMol.

Mi conjetura es que parte del código de PyMol se está vinculando con una biblioteca diferente que ha cambiado bajo la actualización de Yosemite.

Cuando tengo varias versiones de Python instaladas, a veces puede ser difícil asegurarse de que el código esté usando la versión correcta de las bibliotecas. Esto es particularmente válido para todas las versiones de SO, ya que muchas bibliotecas son actualizadas por Apple.