He tenido instancias de personas que eliminaron mis aplicaciones (de forma intencional o no) y es una verdadera molestia recuperarlas, además de que pierdas todos tus datos. ¿Hay alguna forma de proteger con contraseña la eliminación de aplicaciones, tal vez mediante el uso de un truco de Cydia?
No hay necesidad de un jailbreak. Simplemente vaya a Configuración > General > Restricciones y no permita "Eliminar aplicaciones". Las restricciones se protegen con una contraseña como su código de acceso de bloqueo (aunque puede ser un código diferente si lo desea).
Lea otras preguntas en las etiquetas security applications ios