Son dos copias de seguridad separadas. Time Machine realizará una copia de seguridad de cualquier unidad conectada actualmente.
Hago uso de esto para alternar dos Mac en mi hogar entre dos discos de Time Machine. Cada unidad contiene una copia completa de cada Mac desde la última vez que se conectó, así como todas las instantáneas realizadas en esa unidad que no se han eliminado para hacer espacio. Por lo tanto, cualquiera de los dos es útil por sí solo para fines de restauración, incluso si el otro está destruido o dañado.
Si conecta dos unidades simultáneamente, se produce el mismo resultado (cada unidad es una copia de seguridad completa); Time Machine alternará la copia de seguridad de cada uno.