Me gustaría cargar archivos PDF en un iPad. Después de agregarlos a la Biblioteca de iTunes (iTunes - > Archivos - > Agregar a la biblioteca) y sincronizar, se cargan en el iPad, pero también se copian localmente en ~ / Música / iTunes / iTunes Media / Libros.
¿Hay alguna forma de evitar que los archivos se copien en mi directorio de inicio? Solo los quiero en dos lugares: un disco duro externo y el iPad.
En una Mac: arrastre los archivos a iTunes con la tecla opción hacia abajo y los archivos no se copiarán en su carpeta iTunes Media .
Ese es el resultado exacto que te gusta.
También existe la opción de cambiarlo para que no tenga que presionar la tecla de opción: 
Puede presionar la tecla de opción después de cambiar esa configuración para copiarla a propósito. (Exactamente lo contrario de la configuración predeterminada)
Buena suerte :)