No he oído hablar de ningún problema específico con 5.0.3 y 10.6.6.
Sin embargo, hay momentos en que las actualizaciones a Safari romperán cosas como complementos o extensiones. Recomiendo desactivar todas las extensiones y complementos a través de las preferencias de Safari. Luego, puede habilitar un complemento o extensión a la vez y visitar un sitio web que sepa que bloqueará su navegador. Si las cosas funcionan bien, repita este proceso para cada complemento o extensión hasta que descubra el que está causando que las cosas se rompan. Una vez que encuentre al culpable, es posible que tenga que esperar hasta que emitan una nueva versión.
Habiendo dicho todo esto, es muy probable que sus bloqueos estén relacionados con Flash. Flash es un vector conocido para los bloqueos de Safari en Mac OS X y Apple ha declarado repetidamente que la mayoría de los registros de bloqueos que reciben están relacionados con Flash.
Incluso si no estuvieras experimentando estos bloqueos, recomendaría obtener algo como Click2Flash para deshabilitar Flash en todos los sitios web. -esta es una gran manera de deshacerse de los anuncios molestos. Esto debería reducir considerablemente la cantidad de accidentes en Safari, asumiendo que lo que Apple dice es cierto. Con Click2Flash, siempre puede incluir en la lista blanca sitios web específicos para que pueda desbloquear su contenido de Flash o puede desbloquear elementos de Flash haciendo clic por clic (hehce el nombre, Click2Flash).
Espero que esto ayude.