Me gustaría agregar una aclaración a la excelente expansión de @ stuffe en la respuesta de @phphorious. Esto es algo que veo que sucede mucho, tanto en usuarios de Mac de larga data como en usuarios adoptados que vienen de otros sistemas.
@stuffe afirma: "Nada vive en el Dock de forma permanente, todo lo que debe tener un acceso directo o un enlace al archivo real que se espera que resida en otro lugar".
Esto es correcto, pero solo quiero señalar que no es necesario hacer un acceso directo al archivo y luego arrastrarlo al dock. Los iconos en el muelle son, por su propia naturaleza, accesos directos. Y sé que @stuffe no dijo que tenías que hacer un atajo, pero como dije, la gente hace esto mucho, cuando escuchan que los íconos en el dock son atajos.
Mac usa mucho esta estrategia. Lo mismo ocurre con los íconos en la barra lateral y en la barra de tareas. Y muchas otras aplicaciones en tu Mac.
Ejemplo: en iPhoto, solo las fotos en la Biblioteca son las verdaderas, y por lo tanto, se pueden eliminar realmente. Las fotos puestas en álbumes aparecen como las fotos reales, pero en realidad los álbumes son solo un método organizativo. Eliminar las fotos de los álbumes no elimina las fotos, solo elimina su referencia organizativa, o acceso directo, dentro del álbum.