Como la mayoría de las cosas en la vida, creo que depende :-)
En un extremo, es posible que desee hacer una copia de seguridad de todo, de modo que, en caso de que se produzca una falla en el disco, pueda restaurar exactamente dónde se encontraba: cada aplicación, archivo, configuración, configuración, & c. Esto no es realmente práctico para hacer manualmente. (Necesitaría acceso de root, saber exactamente qué archivos vm / cache excluir, qué sincronizar primero, & c.) Uso Carbon Copy Cloner y SuperDuper! para crear clones, y Time Machine para copias de seguridad incrementales.
En el otro extremo, es posible que solo desee realizar una copia de seguridad de los archivos más irreemplazables (por ejemplo, documentos y / o fotos). Esto debería ser lo más fácil, pero, por supuesto, requerirá la mayor parte del trabajo en el caso de una falla (volver a descargar y reinstalar aplicaciones, volver a configurar toda la configuración, & c). Para esto, sabrás dónde están los archivos; es fácil arrastrarlos a otro disco.
Para algo en el medio, depende de lo que hayas cambiado y de cuánto esfuerzo quieras poner ...
Creo que la pregunta ya ha incluido las tres áreas más importantes: si haces una copia de seguridad de /Users , /Applications y /Library , entonces probablemente incluirás todas las cosas importantes para la mayoría de las personas.
Si hay algo vital en otra parte, entonces probablemente lo sabrá, ¡porque lo habrá configurado usted mismo! Los ejemplos pueden incluir: programas que haya compilado e instalado en /usr/local (o que Homebrew & c haga por usted); las entradas del archivo hosts que ha agregado a /etc/hosts ; directorios que has creado en / ; los locales que creaste en /usr/local/share/locale ; los scripts diarios / semanales / mensuales que creó o vinculó bajo /etc/periodic/ ; un mensaje del día que escribiste a /etc/motd ; y así. (Si ha desactivado Protección de integridad del sistema , incluso podría escribir en /bin o /usr/bin …)
También tenga en cuenta que las aplicaciones, los controladores y cualquier otra cosa que no sea datos simples deberán cuidarse para preservar el usuario, grupo, permisos, ACL, & c; la mayoría de los sistemas de archivos externos no son totalmente compatibles con todos esos. Y es posible que necesite acceso de root para hacer una copia de seguridad y / o restaurar algunas cosas. Con todo, ¡es mucho más fácil dejarlo en un programa dedicado!
Finalmente, esta es una buena oportunidad para recordar a todos la importancia de las copias de seguridad. No hay una sola estrategia correcta; Las necesidades de cada uno son diferentes. Pero, por favor, piense sobre lo que sucedería si un disco muriera, y haga todo lo necesario para evitar que se convierta en un desastre.