Sal de iTunes. Luego puede ir a su directorio "~ / Música / iTunes / Mobile \ Aplicaciones /" y eliminar aplicaciones manualmente usando el Terminal o el Finder. Antes de la próxima Sincronización, en iTunes, haga clic y presione la tecla control para seleccionar el elemento de menú "Restablecer advertencias" de su dispositivo. Durante la próxima sincronización, iTunes puede preguntarle si desea (re) copiar los archivos comprados desde el dispositivo. Solo di no. iTunes se confundirá, pero las aplicaciones permanecerán en el dispositivo, y no en tu HD.
Sería mejor hacer primero una copia de respaldo de su directorio de aplicaciones móviles con Time Machine, o en otro HD, antes de jugar con datos internos de iTunes como este.